| RUNX3 | Q13761 | AC099522.1-202 | ENST00000514718 | 367 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BAALC-AS1-205 | ENST00000521102 | 613 nt | TSL 3 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIH1D2-208 | ENST00000532211 | 1103 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC128707.1-201 | ENST00000552230 | 494 nt | TSL 3 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC018523.2-201 | ENST00000555531 | 1221 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETP1-201 | ENST00000556014 | 845 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006116.4-201 | ENST00000589671 | 452 nt | TSL 2 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGKV1OR2-118-201 | ENST00000603238 | 347 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PHACTR2P1-201 | ENST00000605639 | 1414 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445363.3-201 | ENST00000623080 | 671 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MYBPC1-202 | ENST00000361685 | 3871 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMAD5-212 | ENST00000545620 | 6937 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MATR3-228 | ENST00000620916 | 3134 nt | TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE3A-203 | ENST00000428984 | 2986 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NAMPTP1-201 | ENST00000440465 | 2514 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LCA5L-203 | ENST00000380671 | 2080 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC019197.1-201 | ENST00000638199 | 3611 nt | TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TCP1P3-201 | ENST00000414406 | 1498 nt | BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP002518.1-201 | ENST00000534904 | 3837 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AK9-204 | ENST00000424296 | 6326 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GABRA3-201 | ENST00000370314 | 3712 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IQGAP2-204 | ENST00000502745 | 3404 nt | TSL 2 BASIC | 4.42 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF117-201 | ENST00000282869 | 9080 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZBBX-202 | ENST00000392764 | 2849 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CNTN5-201 | ENST00000279463 | 5925 nt | TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIK3CB-214 | ENST00000544716 | 3181 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | USP44-201 | ENST00000258499 | 4022 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM135A-210 | ENST00000505868 | 5173 nt | TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF382-204 | ENST00000439428 | 2742 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MBNL3-201 | ENST00000370839 | 1575 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | R3HDM1-204 | ENST00000410054 | 4442 nt | TSL 2 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FAM49B-212 | ENST00000519110 | 1902 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MGC32805-205 | ENST00000510972 | 1424 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIGW-206 | ENST00000620233 | 2264 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LIMA1-214 | ENST00000552783 | 3612 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PKIB-202 | ENST00000354275 | 1043 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-697P-201 | ENST00000363348 | 107 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PMS1-202 | ENST00000374826 | 948 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-152P-201 | ENST00000384037 | 107 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SPINK13-201 | ENST00000398450 | 509 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CBX1P3-201 | ENST00000413296 | 527 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEACAMP8-201 | ENST00000413902 | 580 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CBLL1-202 | ENST00000415884 | 804 nt | TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108032.1-201 | ENST00000416706 | 207 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SOS1-IT1-201 | ENST00000420644 | 539 nt | TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EIF1P3-201 | ENST00000423841 | 334 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEACAMP1-201 | ENST00000434624 | 1035 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01378-202 | ENST00000437514 | 783 nt | TSL 3 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P2-201 | ENST00000440331 | 348 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL21P89-201 | ENST00000444021 | 467 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL139275.2-201 | ENST00000444731 | 539 nt | TSL 3 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP81-201 | ENST00000455252 | 467 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC109992.2-201 | ENST00000460977 | 765 nt | TSL 3 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC124242.1-202 | ENST00000499554 | 1052 nt | TSL 3 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SAP18P1-201 | ENST00000512058 | 390 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC108064.1-201 | ENST00000513791 | 460 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP31-201 | ENST00000514859 | 294 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RFPL4AP5-201 | ENST00000514977 | 504 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP446-201 | ENST00000515955 | 82 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-513P-201 | ENST00000516104 | 104 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10D4P-201 | ENST00000525892 | 951 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | SNHG1-208 | ENST00000538266 | 347 nt | TSL 3 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006065.3-201 | ENST00000541769 | 419 nt | TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC012414.2-201 | ENST00000559474 | 187 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DISC1FP1-202 | ENST00000562245 | 774 nt | TSL 3 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC076968.1-201 | ENST00000566418 | 429 nt | TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC027281.1-201 | ENST00000574178 | 758 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4286-201 | ENST00000580651 | 93 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC093330.1-201 | ENST00000583326 | 568 nt | TSL 4 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006130.2-201 | ENST00000586202 | 326 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BNIP3P33-201 | ENST00000598912 | 569 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092474.3-201 | ENST00000603022 | 568 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-89P-201 | ENST00000607443 | 133 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC106730.3-201 | ENST00000624568 | 641 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SATB1-AS1-243 | ENST00000627546 | 589 nt | TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARL15-202 | ENST00000504924 | 2486 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARL15-207 | ENST00000620747 | 2486 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CROT-204 | ENST00000442291 | 1993 nt | TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OSBPL9P1-201 | ENST00000604744 | 1469 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CR382285.2-201 | ENST00000624662 | 1495 nt | BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GMNC-201 | ENST00000442080 | 3422 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DYTN-201 | ENST00000452335 | 2051 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.41 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAPK10-320 | ENST00000641462 | 6696 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PPEF1-202 | ENST00000361511 | 2890 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157756.1-201 | ENST00000532515 | 2859 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYLD-212 | ENST00000568704 | 3292 nt | TSL 5 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RALGAPA1-204 | ENST00000553892 | 6271 nt | TSL 5 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP2C1-205 | ENST00000504381 | 3498 nt | TSL 2 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HGF-202 | ENST00000354224 | 1425 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCN1A-210 | ENST00000635776 | 10107 nt | TSL 5 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.7 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TFPI-203 | ENST00000392365 | 3649 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRF1-201 | ENST00000279545 | 1091 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP307-201 | ENST00000362863 | 116 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-44P-201 | ENST00000363050 | 141 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP130-201 | ENST00000364431 | 114 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP513-201 | ENST00000364648 | 118 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNA5SP151-201 | ENST00000365632 | 117 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DEFB127-201 | ENST00000382388 | 514 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DPYD-AS2-201 | ENST00000422259 | 788 nt | TSL 3 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |