Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
RUNX3Q13761 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RUNX3Q13761 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RUNX3Q13761 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RUNX3Q13761 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RUNX3Q13761 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RUNX3Q13761 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
RUNX3Q13761 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
RUNX3Q13761 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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