Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms