Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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TRAF1Q13077 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAF1Q13077 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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