Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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FOXD4Q12950 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXD4Q12950 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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