Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
SCAPQ12770 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SCAPQ12770 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms