Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
EPHB4P54760 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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