Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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HOXD13P35453 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD13P35453 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD13P35453 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD13P35453 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD13P35453 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD13P35453 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD13P35453 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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HOXD13P35453 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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HOXD13P35453 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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HOXD13P35453 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD13P35453 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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HOXD13P35453 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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HOXD13P35453 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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HOXD13P35453 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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HOXD13P35453 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXD13P35453 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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