Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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PTPRAP18433 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPRAP18433 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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