Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SH3BP4Q9P0V3 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4Q9P0V3 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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