Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SMG9Q9H0W8 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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