Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
AP5B1Q2VPB7 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms