Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CBFBQ13951 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CBFBQ13951 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms