Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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CUL4AQ13619 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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CUL4AQ13619 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CUL4AQ13619 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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CUL4AQ13619 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CUL4AQ13619 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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