Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SF3B2Q13435 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms