Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms