Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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HOXD10P28358 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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HOXD10P28358 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
HOXD10P28358 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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