Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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SH3BP1Q9Y3L3 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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SH3BP1Q9Y3L3 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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SH3BP1Q9Y3L3 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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