Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPRHQ9HD43 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.8 ms