Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms