Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SALL3Q9BXA9 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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SALL3Q9BXA9 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SALL3Q9BXA9 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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