Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms