Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR4D9-201ENST00000329328 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 UBE2D3-206ENST00000357194 660 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPS10P2-201ENST00000430953 494 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL392003.2-201ENST00000451015 679 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC02543-201ENST00000451285 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC008481.2-201ENST00000483614 531 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RN7SL416P-201ENST00000494042 298 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC113208.1-201ENST00000497944 318 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SLC25A5P9-201ENST00000509905 910 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC103409.1-202ENST00000518416 577 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AP003499.1-201ENST00000527217 574 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 STH-201ENST00000537309 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 IGKV2D-28-202ENST00000558026 306 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC011767.1-203ENST00000559762 529 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC093826.2-201ENST00000579042 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RN7SL493P-201ENST00000580401 299 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RN7SL405P-201ENST00000582502 289 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZIM2-202ENST00000593931 483 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC063977.1-201ENST00000600623 371 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL121928.1-201ENST00000608017 521 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ILK-216ENST00000627400 111 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms