Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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HERC1Q15751 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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HERC1Q15751 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
HERC1Q15751 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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