Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
BRD3Q15059 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms