Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CNGB1Q14028 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms