Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
ITGA7Q13683 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ITGA7Q13683 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms