Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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TCOF1Q13428 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TCOF1Q13428 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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