Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms