Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LTBRP36941 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 KCNJ1-205ENST00000392666 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LTBRP36941 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms