Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRGP23470 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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