Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPRBP23467 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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PTPRBP23467 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PTPRBP23467 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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