Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
PKHD1P08F94 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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PKHD1P08F94 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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PKHD1P08F94 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PKHD1P08F94 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PKHD1P08F94 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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