Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC9Q9UKV0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC9Q9UKV0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms