Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SRP68Q9UHB9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRP68Q9UHB9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms