Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LHX9Q9NQ69 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms