Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Clstn1Q9EPL2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms