Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf6Q9DBU5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms