Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gins3Q9CY94 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gins3Q9CY94 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms