Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx28Q9CWT6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms