Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkiras2Q9CR56 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkiras2Q9CR56 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkiras2Q9CR56 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkiras2Q9CR56 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkiras2Q9CR56 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkiras2Q9CR56 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkiras2Q9CR56 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms