Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc17Q8CE13 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms