Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Usp38Q8BW70 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Usp38Q8BW70 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Usp38Q8BW70 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Usp38Q8BW70 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp38Q8BW70 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Usp38Q8BW70 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Usp38Q8BW70 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Usp38Q8BW70 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Usp38Q8BW70 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp38Q8BW70 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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