Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l1Q61985 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l1Q61985 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l1Q61985 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l1Q61985 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nfe2l1Q61985 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Nfe2l1Q61985 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nfe2l1Q61985 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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