Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF20Q5VTR2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF20Q5VTR2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms