Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trav8d-2Q5R1B6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms