Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
V1rd19Q3KNP5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
V1rd19Q3KNP5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms