Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TCIRG1Q13488 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
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