Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cnn1Q08091 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnn1Q08091 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms