Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ldb1P70662 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms