Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nup43P59235 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nup43P59235 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms